Les projets de recherche du Service de la génétique, de la reproduction et de l'écologie se répartissent dans les créneaux suivants : l'écologie forestière, les écosystèmes et l'environnement, l'amélioration génétique des arbres et la production de semences et de plants. À cela s'ajoute l'expertise offerte, à l'échelle de la direction, par l'équipe de Géomatique.
Les travaux des diverses équipes de recherche du service répondent aux besoins les plus essentiels en matière d'acquisition de connaissances sur les processus et les fonctions des écosystèmes associés à l'aménagement forestier durable; ils sont aussi liés au développement de nouveau matériel végétal.
Pour remplir leurs mandats respectifs, les chercheurs du service disposent d'équipes techniques qualifiées qui assurent l'application des protocoles de recherche. En plus de l'effort constant déployé pour l'intégration des nouvelles connaissances à la pratique forestière, ils interagissent avec des scientifiques d'autres organisations, tant nationales qu'internationales, afin d'enrichir le secteur forestier québécois d'innovations ou de contribuer au rayonnement de la culture scientifique québécoise.